Wśród najbardziej znaczących osiągnięć Ośrodka w tej dziedzinie warto wymienić między innymi przede wszystkim takie opracowania jak analizę celowości utworzenia Spółki do prowadzenia kolejowych kwalifikowanych przewozów pasażerskich, biznes plan w zakresie zakupu i eksploatacji na sieci PKP 16 pociągów zespolonych z wychylnym pudłem, analizę celowości wprowadzenia cen relacyjnych w odniesieniu do pociągu w przewozach kwalifikowanych, wstępne studium wykonalności wprowadzenia przez PKP Przewozy Regionalne nowego produktu na linii Warszawa-Łódź wraz z analizą organizacji i zarządzania przewozami oraz prognozy przewozowe i analizy rynkowe wykonane dla przewoźników towarowych.